文件名称：genomescope:来自未组装的短读段的快速基因组分析
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更新时间：2024-05-31 15:24:04
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GenomeScope：来自未组装的短读段的快速基因组分析 Vurture，GW，Sedlazeck，FJ，Nattestad，M，Underwood，CJ，Fang，H，Gurtowski，J，Schatz，MC（2017） Bioinformatics doi： ://doi.org/10.1093/bioinformatics/btx153 从头组装技术的当前发展集中在相对简单的基因组上。 即使是人类基因组，其杂合率仅为〜0.1％且具有2n二倍体结构，也比许多其他物种（尤其是植物）要简单得多。 但是，基因组学正在Swift向测序更复杂的物种（如菠萝，甘蔗或小麦）测序，这些物种具有更高的杂合率（菠萝> 1％），更高的倍性（甘蔗为8n）和更大的基因组（16Gbp小麦）。 对新物种进行测序时的首要目标之一是确定基因组结构的总体特征，包括基因组大小，重复元件的丰度和杂合率。 这些功能是