文件名称：kiki:来自新的宏基因组组装
文件大小：71KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-07-26 15:47:43
C
琪琪 从头宏基因组组装器 安装 克隆 Kiki 存储库 git 克隆 （或 'git clone git://github.com/GeneAssembly/kiki.git' 用于只读访问） 确保安装了 CMake 构建和测试 cd 琪琪目录光盘仓.. 使气./ki -i ../test/short.fa -o 测试cat test.contig* | ../scripts/tab2fa.pl >test.fa 处理 contig 文件的脚本 (kiki/scripts/) 示例 1：按长度对 contigs 进行排序并创建一个包含长度超过 1kb 的 contigs 的 fasta 文件。 cat test.contig* | 排序-k2nr | tab2fa.pl -m 1000 >test.fa 示例2：将fasta contig文件转换为制表符分隔的格式：[ id,
【文件预览】：
kiki-master
----hash_chain.h(2KB)
----debug.c(1KB)
----comm.c(4KB)
----raiphy.h(1KB)
----raiphy.c(13KB)
----hash_oa.h(2KB)
----comm.h(2KB)
----hash_oa.c(13KB)
----mem.c(6KB)
----Makefile.bgq(318B)
----io.h(1KB)
----hash.h(124B)
----hash_chain.c(12KB)
----asm.c(18KB)
----scripts()
--------fa2tab.pl(505B)
--------tab2fa.pl(620B)
----README.md(3KB)
----util.c(247B)
----mem.h(1KB)
----seq.h(2KB)
----util.h(103B)
----ki.h(9KB)
----rai.c(4KB)
----demo.c(4KB)
----search.c(5KB)
----extern.h(3KB)
----io.c(6KB)
----rait.c(5KB)
----test()
--------short.fa(776B)
----CMakeLists.txt(2KB)
----seq.c(25KB)
----ki.c(112KB)
----debug.h(711B)