quast:基因组装配评估工具

时间:2021-05-10 12:35:51
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文件名称:quast:基因组装配评估工具
文件大小:221.15MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-10 12:35:51
visualization bioinformatics genome-assembly-evaluation contigs AMPL 基因组装配评估工具 QUAST代表“质量评估工具”。 它通过计算各种指标来评估基因组/元基因组装配。 当前的QUAST工具包包括用于基因组装配的通用QUAST工具,MetaQUAST(用于宏基因组数据集的扩展),QUAST-LG(用于大型基因组(例如哺乳动物)的扩展)以及Icarus(用于这些工具的交互式可视化工具)。 QUAST软件包在有或没有参考基因组的情况下均可工作。 但是,如果至少有一个紧密的参考基因组与装配体一起提供,则将提供更多信息。 该工具可以接受多个组件,因此适合进行比较。 该README文件简要介绍了QUAST的安装,基本用法和输出解析。 提供了有关这些主题和许多其他主题的详细说明。 QUAST工具包的最新稳定版本还有更多安装方法,在将讨论所有安装方法。 对于最新版本,请克隆我们的 。 请参考文件以获取版权和引用说明。 系统要求 支持Linux(64位和32位,功能

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