文件名称：quast:基因组装配评估工具
文件大小：221.15MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 06:22:31
visualization bioinformatics genome-assembly-evaluation contigs AMPL
基因组装配评估工具 QUAST代表“质量评估工具”。 它通过计算各种指标来评估基因组/元基因组装配。 当前的QUAST工具包包括用于基因组装配的通用QUAST工具，MetaQUAST（用于宏基因组数据集的扩展），QUAST-LG（用于大型基因组（例如哺乳动物）的扩展）以及Icarus（用于这些工具的交互式可视化工具）。 QUAST软件包在有或没有参考基因组的情况下均可工作。 但是，如果至少有一个紧密的参考基因组与装配体一起提供，则将提供更多信息。 该工具可以接受多个组件，因此适合进行比较。 该README文件简要介绍了QUAST的安装，基本用法和输出解析。 提供了有关这些主题和许多其他主题的详细说明。 QUAST工具包的最新稳定版本还有更多安装方法，在将讨论所有安装方法。 对于最新版本，请克隆我们的 。 请参考文件以获取版权和引用说明。 系统要求 支持Linux（64位和32位，功能