assemblyQC:这是一个用于评估常见基因组装配质量参数的Python程序

时间:2024-05-05 13:14:59
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文件名称:assemblyQC:这是一个用于评估常见基因组装配质量参数的Python程序

文件大小:14KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-05 13:14:59

Python

assemblyQC.py 这是一个用于评估常见基因组装配质量参数的Python程序。 由托马斯·尼尔森(Thomas Nelson)撰写。 此脚本需要Biopython模块和Python 3.4或更高版本。 在此处获取Biopython模块: ://biopython.org/wiki/Download。 用法:python assemblyQC.py [包含程序集的FASTA文件名] 该程序将在使用标准服务器类Linux盒的2.5 Gbp基因组装配上在一两分钟内返回结果。


【文件预览】:
assemblyQC-master
----assemblyQC.py(2KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(485B)

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