文件名称：Trycycler:用于生成细菌基因组的共识长读程序集的工具
文件大小：2.8MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-22 06:44:43
Python
Trycycler是用于为细菌基因组生成共识的长读装配的工具。 也就是说，如果您有多个用于同一隔离的长时间读取的程序集，Trycycler可以将它们组合成一个比任何输入都要好的程序集。 有关安装说明，用法，更深入的说明等，请转到 ！
【文件预览】：
Trycycler-main
----MANIFEST.in(111B)
----trycycler-runner.py(997B)
----images()
--------logo.png(121KB)
----requirements.txt(29B)
----LICENSE(34KB)
----test()
--------test_consensus.py(11KB)
--------test_misc()
--------test_pairwise.py(4KB)
--------test_msa.py(6KB)
--------__init__.py(0B)
--------test_subsample.py(5KB)
--------test_misc.py(11KB)
--------README.md(402B)
--------test_int_range.py(2KB)
--------test_subsample()
--------test_initial_check.py(3KB)
--------test_cluster()
--------test_software.py(2KB)
--------test_dotplot.py(3KB)
--------test_cluster.py(10KB)
----setup.py(2KB)
----README.md(706B)
----trycycler()
--------intrange.py(3KB)
--------settings.py(1KB)
--------reconcile.py(7KB)
--------misc.py(9KB)
--------partition.py(6KB)
--------circularisation.py(16KB)
--------software.py(6KB)
--------mash.py(4KB)
--------help_formatter.py(7KB)
--------pairwise.py(3KB)
--------subsample.py(8KB)
--------log.py(2KB)
--------consensus.py(29KB)
--------__init__.py(0B)
--------__main__.py(17KB)
--------cluster.py(14KB)
--------msa.py(9KB)
--------alignment.py(5KB)
--------data()
--------starting_seq.py(9KB)
--------initial_check.py(4KB)
--------version.py(870B)
--------dotplot.py(11KB)
----.gitignore(1KB)