文件名称:virathon:古细菌和细菌病毒的基因组分析
文件大小:25KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-06 15:38:17
Python
Virathon:古细菌和细菌病毒的基因组分析 介绍 Virathon旨在自动分析古细菌和细菌的病毒基因组,特别是源自宏基因组学样本的未经培养的病毒基因组 依存关系 Virathon用Python 3编写,并使用多种外部依赖关系。 指令 使用vpf-class运行主机预测和分类分配: python3 virathon_v0.1.py --genome_files My_Genomes.fasta --call_vpf_class True 这将生成以下文件: VPF_Class_My_Genomes目录,其中包含:baltimore.tsv family.tsv genus.tsv host_domain.tsv host_family.tsv host_genus.tsv 从基因组Fasta文件开始使用RaFAH运行主机预测: python3 virathon_v0.1.p
【文件预览】:
virathon-main
----virathon_v0.1.py(55KB)
----LICENSE(34KB)
----README.md(3KB)