Bacterial Makeup Explorer:细菌标记物分析细菌基因组直向同源图-开源

时间:2024-05-20 13:02:13
【文件属性】:

文件名称:Bacterial Makeup Explorer:细菌标记物分析细菌基因组直向同源图-开源

文件大小:2.37MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-20 13:02:13

开源软件

BMX(细菌成分补充剂)可从直系同源图计算出核心基因组的大小和组成。


【文件预览】:
BMX
----.DS_Store(6KB)
----N.pl(1KB)
----example_output_files()
--------example_output_final_cg_size.txt(3KB)
--------example_output_Genome_QC_heatmap.pdf(567KB)
--------example_output_core_genome.pdf(113KB)
--------example_output_not_cg.txt(98B)
----K.pl(730B)
----E.bs(36KB)
----BMX_index.html(56KB)
----plot.sh(267B)
----w2.pl(233B)
----O.pl(1KB)
----.RData(8KB)
----L.pl(2KB)
----plot.R(311B)
----M.pl(104B)
----start_BMX.sh(913B)
----BMX2.bs(19KB)
----wE.pl(246B)
----test_output_n=16_genomes.out(586KB)
----test_output_n=70_genomes.out(2.39MB)
----w3.pl(248B)
----BMX3.bs(21KB)
----test_output_n=140_genomes.out(4.54MB)
----B.pl(1KB)
----Genome_QC_R_commands.R(454B)
----U.pl(877B)

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