【文件属性】:
文件名称:ClonalOrigin:使用全基因组序列推断细菌中的同源重组
文件大小:222KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-20 07:02:42
C++
克隆起源
介绍
与我们不同,细菌可以自行繁殖。 但是,它们确实具有在生物体之间转移DNA的机制,这一过程更正式地称为重组。 在实验室中已经广泛研究了发生重组的机制,但是关于在自然细菌种群中如何,何时何地进行重组以及如何帮助其适应新环境仍有许多尚待理解。 ClonalOrigin对细菌基因组样本的序列进行比较分析,以重建其祖先发生的重组事件。
下文介绍了ClonalOrigin:
Didelot X,Lawson D,Darling A,Falush D(2010)使用全基因组序列推断细菌中的同源重组。 遗传学186(4),1435-1449 doi:10.1534 / genetics.110.120121
用法
有关如何下载和安装ClonalOrigin的说明,请参见: :
有关安装后如何使用ClonalOrigin的说明,请访问: :
估计重组过程中的偏倚强度
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