文件名称:SOAPfuse:一种从双端 RNA-Seq 数据中识别融合转录本的工具-开源
文件大小:40.84MB
文件格式:GZ
更新时间:2024-07-18 17:33:57
开源软件
SOAPfuse 是一种开源工具,开发用于从双端 RNA-Seq 数据中全基因组检测融合转录本。 与之前发布的工具相比,SOAPfuse 具有良好的性能。 它是用 perl 开发的,只能在 linux 操作系统上使用。 运行整个分析需要大约 8G 内存。 到目前为止,它仅用于分析人类 RNA-Seq 数据。 SOAPfuse 已在 Genome Biology 上作为 Method 文章发表,请查看 http://genomebiology.com/2013/14/2/R12 SOAPfuse 官方网站(*已过期)是 http://soap.genomics.org.cn/ soapfuse.html SOAPfuse 的 wiki 主页是 https://sourceforge.net/p/soapfuse/wiki/Home SOAPfuse Perl 模块的 GitHub 存储库是 https://github.com/Nobel-Justin/SOAPfuse_PM