HiC:HiC分析以推断染色体间和染色体内的相互作用

时间:2024-05-31 22:23:30
【文件属性】:

文件名称:HiC:HiC分析以推断染色体间和染色体内的相互作用

文件大小:29KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-31 22:23:30

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嗝 HiC分析以推断染色体间和染色体内的相互作用。 HiCUP的用户指南非常简单。 从HiCUP获得bam输出后,就可以使用GOTHiC_for_HiCUP文件夹中的脚本来分析输出。


【文件预览】:
HiC-master
----HiC_To_BED12.R(3KB)
----SeqMonk_user_guide.txt(1KB)
----HiCUP()
--------HiCUP_tutorial.txt(1KB)
--------hicup.conf(2KB)
----README.md(237B)
----GOTHiC_for_HiCUP()
--------GOTHiC_for_HiCUP.R(2KB)
--------callInteractions.R(39KB)
--------mapReadsToHindIII.R(15KB)
--------GenomicInteraction.R(15KB)
--------binomial_method_HiC.R(35KB)
--------ImportHicup.R(2KB)

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