文件名称：schmid滤波函数matlab源码-Hic_tools_collection:Hic_tools_collection
文件大小：33KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-08 13:56:57
系统开源
schmid滤波函数matlab源码与Hi-C数据分析相关的工具和论文的集合 对Hi-C工具的引用的集合（不断更新）。 相关资料库：，。 欢迎发布和/或请求添加其他数据的请求！ 表中的内容 流水线 可用管道，URL的列表。 ， 每个管道中可用的分析选项。 ， cword -perl cworld模块和用于C数据（3C，4C，5C，Hi-C）的实用程序/分析脚本的集合。 Juicer -全Java的管道将原始读为Hi-C地图，在Juicebox可视化。 调用域，循环，CTCF绑定站点。 .hic文件格式，用于存储多分辨率Hi-C数据。 Durand，Neva C.，Muhammad S.Shamim，Ido Machol，Suhas SP Rao，Miriam H.Huntley，Eric S.Lander和Erez Lieberman Aiden。 “ Juicer提供了一键式系统来分析回路分辨率Hi-C实验。” 细胞系统3号。 1（2016年7月）：95-98。 。 Rao，Suhas SP，Miriam H.Huntley，Neva C.Durand，Elena K.Stameno
【文件预览】：
Hic_tools_collection-master
----pipelines_list.csv(690B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(84KB)
----pipeline_comparison.csv(585B)