schmid滤波函数matlab源码-HiC_tools:一组Hi-C数据分析工具

时间:2024-06-08 13:56:41
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文件名称:schmid滤波函数matlab源码-HiC_tools:一组Hi-C数据分析工具

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更新时间:2024-06-08 13:56:41

系统开源

schmid滤波函数matlab源码Hi-C数据分析工具和论文 工具按发布日期排序,最新的排在最前面。 每节末尾列出了未发布的工具。 请参阅和更多。 请, ! 有关其他与数据科学和基因组学有关的说明,请参见。 表中的内容 流水线 -Java完整管道,可将原始读取内容转换为Hi-C地图,并在Juicebox中可视化。 调用域,循环,CTCF绑定站点。 .hic文件格式,用于存储多分辨率Hi-C数据。 Durand,Neva C.,Muhammad S.Shamim,Ido Machol,Suhas SP Rao,Miriam H.Huntley,Eric S.Lander和Erez Lieberman Aiden。 “。” 细胞系统3号。 1(2016年7月) Rao,Suhas SP,Miriam H.Huntley,Neva C.Durand,Elena K.Stamenova,Ivan D.Bochkov,James T.Robinson,Adrian L.Sanborn等。 “。” 单元格159号7(2014年12月18日) -榨汁机分析示例。 通过频繁互动定义的TAD。 富含C


【文件预览】:
HiC_tools-master
----CONTRIBUTING.md(327B)
----LICENSE(1KB)
----README.md(178KB)
----pipeline_comparison.csv(585B)
----pipelines_list.csv(690B)
----img()
--------3C_technologies.png(42KB)

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