HiC_tools:Hi-C 数据分析工具集

时间:2024-08-12 20:08:51
【文件属性】:

文件名称:HiC_tools:Hi-C 数据分析工具集

文件大小:108KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-08-12 20:08:51

Hi-C 数据分析工具和论文 工具按出版日期排序,最新的排在最前面。 未发布的工具列在每个部分的末尾。 有关请参阅和。 请! 有关其他数据科学和基因组学相关的说明,请参阅说明。 表中的内容 正常化CNV感知归一化 再现性 AB隔间 循环调用者捕获-C 峰 微分互动差异丰度 TAD 来电者 建筑条纹 差异/时程 TAD 分析 3D特征预测 面向SNP CNV 和结构变异检测 可视化 从头基因组支架 3D建模 解卷积 文件 方法论评论 一般评论 技术 微C 多方互动 正常化 TAD检测 光谱聚类 网址课程 管道 Juicer - Java 完整管道将原始读取转换为 Hi-C 映射,在 Juicebox 中可视化。 调用域、循环、CTCF 绑定站点。 .hic文件格式,用于存储多分辨率 Hi-C 数据。 https://github.com/theaidenlab/juicebox/wi


【文件预览】:
HiC_tools-master
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--------3C_technologies.png(42KB)
----pipelines_list.csv(690B)
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----CONTRIBUTING.md(327B)
----README.md(185KB)
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