hic-straw:命令行和Web实用程序,用于读取.hic联系人矩阵文件

时间:2024-06-12 10:05:58
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文件名称:hic-straw:命令行和Web实用程序,用于读取.hic联系人矩阵文件

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更新时间:2024-06-12 10:05:58

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稻草 命令行和Web实用程序,用于读取.hic联系人矩阵文件 安装 需要Node( ) npm install hic-straw 原料药 getContactRecords 返回分类的联系人计数的集合。 争论 规范化-表示规范化方案的字符串 region 1 {chr,start,end}-以碱基对或片段为单位的基因组区域。 间隔约定是从零开始的1/2打开 区域2 {chr,开始,结束} 单位-碱基对的“ BP”。 目前这是唯一受支持的单位 binSize-每个片段的大小以碱基对或片段为单位。 垃圾箱是方形的 例子 在网页中 脚本标签-参见examples / straw.html < script src =" ../dist/hic-straw.js " > </ script > ... const straw = new HicStraw({


【文件预览】:
hic-straw-master
----rollup.config.js(1KB)
----src()
--------lru.js(848B)
--------binary.js(5KB)
--------straw.js(1KB)
--------contactRecord.js(254B)
--------hicFile.js(30KB)
--------io()
--------matrixZoomData.js(9KB)
--------normalizationVector.js(3KB)
--------matrix.js(3KB)
--------polygons.js(3KB)
--------index.js(53B)
--------vendor()
----examples()
--------script-remote.js(935B)
--------script-es6.js(907B)
--------script.js(857B)
--------straw-es6.html(1KB)
--------straw.html(2KB)
----nvitest.js(1KB)
----.travis.yml(119B)
----LICENSE(1KB)
----test()
--------straw.test.js(7KB)
--------straw.v9.test.js(6KB)
--------hicFile2.test.js(1KB)
--------throttleTest.js(1KB)
--------data()
--------hicFile.test.js(2KB)
--------nodeLocalFile.test.js(715B)
--------remoteFileTest.js(723B)
--------testBufferedFile.js(3KB)
----README.md(3KB)
----dist()
--------hic-straw.min.js.map(704KB)
--------hic-straw.js(477KB)
--------hic-straw.min.js(159KB)
--------hic-straw.esm.js(195KB)
----.babelrc.json(198B)
----docs()
--------faq.md(0B)
----.gitignore(1KB)
----cli.js(3KB)
----package-lock.json(262KB)
----package.json(2KB)

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