文件名称：rust-debruijn:Rust中的De Bruijn图
文件大小：51KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-30 17:55:54
Rust
锈渣 De Bruijn图构建和路径压缩库。 主要特征 2位打包固定长度（Kmer）和可变长度（DnaString）序列容器 不同K值的静态编译代码路径 通过DeBruijn图跟踪任意辅助数据的能力 可定制的kmer计数和过滤方案，支持各种用例 DeBruijn图压缩 最小子串分区到分片kmers，以实现内存高效计数和DeBruijn图压缩 可配置为绞合和非绞合输入序列 广泛的单元测试套件 在生产中用于10x Genomics的Supernova，Lang Ranger，Cell Ranger和Cell Ranger VDJ管道。
【文件预览】：
rust-debruijn-master
----Cargo.toml(736B)
----.github()
--------workflows()
----src()
--------clean_graph.rs(1KB)
--------graph.rs(33KB)
--------bitops_avx2.rs(10KB)
--------dna_string.rs(27KB)
--------kmer.rs(28KB)
--------test.rs(18KB)
--------vmer.rs(6KB)
--------lib.rs(22KB)
--------compression.rs(21KB)
--------msp.rs(19KB)
--------filter.rs(11KB)
----LICENSE(1KB)
----README.md(759B)
----.gitignore(18B)