diffxpy:单细胞RNA-seq数据的差异表达分析

时间:2021-05-06 19:12:42
【文件属性】:
文件名称:diffxpy:单细胞RNA-seq数据的差异表达分析
文件大小:119KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-06 19:12:42
bioinformatics tensorflow transcriptomics gene-set-enrichment differential-expression 对单细胞RNA-seq数据进行快速且可扩展的差异表达分析 diffxpy涵盖了单细胞RNA-seq方案中遇到的各种差异表达分析方案,并已集成到工作流程中。 将diffxpy导入为de,将diffxpy.api导入为de,以访问以下与差异表达分析相关的工具: 测试模块中的差异表达分析。* 基于模块de.enrich。*中的差异表达调用的基因集富集分析 有关这些模块的详细信息,请参考和。
【文件预览】:
diffxpy-master
----MANIFEST.in(50B)
----README.rst(1KB)
----.gitattributes(33B)
----requirements.txt(161B)
----diffxpy()
--------unit_test()
--------fit()
--------_version.py(18KB)
--------__init__.py(315B)
--------log_cfg.py(826B)
--------enrichment()
--------testing()
--------api()
--------stats()
--------pkg_constants.py(474B)
----versioneer.py(67KB)
----LICENSE(2KB)
----setup.cfg(157B)
----setup.py(1KB)
----NOTICE(196B)
----docs()
--------models.rst(2KB)
--------training.rst(2KB)
--------requires.txt(161B)
--------conf.py(5KB)
--------installation.rst(2KB)
--------references.rst(22B)
--------tutorials.rst(3KB)
--------index.rst(438B)
--------Makefile(613B)
--------parallelization.rst(3KB)
--------api()
--------_static()
----.readthedocs.yml(46B)
----.gitignore(214B)

网友评论