SAVER:单细胞 RNA-seq 基因表达恢复

时间:2024-06-18 08:40:21
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文件名称:SAVER:单细胞 RNA-seq 基因表达恢复

文件大小:2.89MB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-18 08:40:21

R

节省 1.1.2 SAVER(通过表达恢复进行单细胞分析)实施正则化回归预测和经验贝叶斯方法,以在嘈杂和稀疏的单细胞 RNA-seq 数据中恢复真实的基因表达谱。 安装 您可以通过运行以下命令从 CRAN 安装 SAVER: install.packages( " SAVER " ) library( SAVER ) 您还可以从 github 安装最新的 SAVER 更新: # install.packages("devtools") devtools :: install_github( " *angx/SAVER " ) 参考 有关该方法的更多信息,请,和。


【文件预览】:
SAVER-master
----vignettes()
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----NAMESPACE(747B)
----NEWS.md(2KB)
----cran-comments.md(244B)
----DESCRIPTION(1018B)
----inst()
--------CITATION(1KB)
----R()
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--------calc_loglik.R(2KB)
--------data.R(801B)
--------cor_adjust.R(2KB)
--------calc_maxcor.R(1KB)
--------saver_fit.R(22KB)
--------calc_posterior.R(2KB)
--------saver.R(6KB)
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--------get_mu.R(604B)
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--------calc_estimate.R(10KB)
--------sample_saver.R(2KB)
--------utils.R(6KB)
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----.travis.yml(134B)
----.Rbuildignore(115B)
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----data()
--------linnarsson_saver.rda(2.4MB)
--------linnarsson.rda(393KB)
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--------calc_estimate.Rd(3KB)
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--------SAVER-package.Rd(820B)
--------linnarsson.Rd(631B)
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----.gitignore(86B)

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