文件名称：scLRTC：scLRTC：通过低秩张量完成输入单细胞RNA-seq数据
文件大小：1.76MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-01 06:02:53
R
scLRTC：通过低秩张量完成对单细胞RNA-seq数据的估算 演示版 如果您想运行我们提供的演示。 步骤1.下载源代码并解压缩MATLAB包。 在MATLAB中将当前目录更改为包含脚本的文件夹。 步骤2.打开demo.m，然后单击运行按钮以获取结果。 然后会生成一个CSV文件。 在此演示中，它称为“ yanltrc.csv”。（行是基因，列是细胞） 如果要使用其他数据集，请将csv文件复制到此文件夹，更改demo.m文件中的文件名和参数，然后单击“运行”按钮以获取结果。 分析 在此文件夹中，我们提供用于单细胞下游分析的部分代码，作为快速实现单细胞下游分析的参考。 SC3软件包是从R Bioconductor（ ）下载的。 TSCAN软件包是从R Bioconductor（ ）下载的。 SEURAT软件包是从（ ）下载的 救命 如果您对使用该软件包有任何疑问或疑问，请联系
【文件预览】：
scLRTC-main
----process.m(465B)
----analysis()
--------plot_mask.py(3KB)
--------TSCAN.R(5KB)
--------simulation.R(1KB)
--------DEMAST.R(4KB)
--------tsnekmeans.R(791B)
--------plot_annotated_heatmap.py(6KB)
--------sc3.R(2KB)
----YANDATA.csv(5.8MB)
----ADMMLRTC.m(1KB)
----README.md(1KB)
----scLRTC.m(2KB)
----yanlabel.csv(543B)
----demo.m(247B)
----private()
--------Pro2TraceNorm.m(801B)
--------Unfold.m(76B)
--------Fold.m(112B)