文件名称：基于R包scCancer修改的单细胞分析基础代码
文件大小：20.43MB
文件格式：ZIP
更新时间：2022-05-01 20:41:50
r语言 单细胞
基于R包scCancer修改的单细胞分析基础代码
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code
----scCancer_test.R(6KB)
----rds()
--------cnvRef_SNN-boneMarrow-MS.RDS(340KB)
--------cnvRef_Data-HM.RDS(10.87MB)
--------cnvRef_SNN-HM.RDS(571KB)
--------cellTypeTemplates.RDS(1.3MB)
--------cnvRef_Data-boneMarrow-MS.RDS(6.46MB)
----LungCancerCode.Rproj(205B)
----.Rhistory(3KB)
----sc_all_function.R(109KB)
----cnvFunction.R(22KB)
----.Rproj.user()
--------shared()
--------1B01A0C3()
----report()
--------geneSets.Rmd(1KB)
--------.Rhistory(0B)
--------contamination.Rmd(249B)
--------filterGene.Rmd(332B)
--------doublet.Rmd(1KB)
--------malignancy.Rmd(4KB)
--------umap.Rmd(279B)
--------cellTypePred.Rmd(2KB)
--------main-scAnnoComb.Rmd(13KB)
--------cellCycle.Rmd(443B)
--------main-scAnno.Rmd(11KB)
--------main-scStat.Rmd(11KB)
--------stemness.Rmd(593B)
--------cellInteraction.Rmd(1KB)
--------cellCalling.Rmd(1KB)
--------malign-comb.Rmd(2KB)
--------diffExpr.Rmd(1004B)
--------filterCell.Rmd(300B)
--------SoupX.Rmd(343B)
--------exprProgram.Rmd(1KB)
----plot_function.R(18KB)
----txt()
--------cellCycle-genes.txt(556B)
--------hallmark-pathways.txt(50KB)
--------gene-chr-hg38.txt(1.14MB)
--------gene.chr.txt(155KB)
--------gene-chr-mm10.txt(1.18MB)
--------gene-chr-hg19.txt(1.15MB)
--------hg-mm-HomologyGenes.txt(212KB)
--------diss-genes.txt(830B)
--------PairsLigRec.txt(57KB)
--------pcbc-stemsig.tsv(348KB)
----scCombination.R(23KB)
----main.R(3KB)