文件名称：vite:R程序包，用于使用图形分析单细胞数据
文件大小：65KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-02 16:16:42
graph scaffold single-cell flow-cytometry mass-cytometry
请使用github问题来报告错误并请求功能 安装 为了安装此软件包，您必须能够在系统上编译C ++源软件包： Windows：安装软件包 Mac OS：从Apple安装可在App Store免费获得的XCode软件。 根据您所使用的XCode的特定版本，您可能还需要单独安装“命令行工具”软件包。 请参考XCode文档 Linux：安装GCC。 请参阅您的发行版文档以找到特定的软件包名称 确保您已安装最新版本（> = 1.9）的devtools install.packages( " devtools " ) 安装flowCore软件包 source( " http://bioconductor.org/biocLite.R " ) biocLite( " flowCore " ) 使用以下命令安装vite devtools :: install_github( " ParkerIC
【文件预览】：
vite-master
----NAMESPACE(622B)
----DESCRIPTION(434B)
----src()
--------filter_matrix.cpp(3KB)
--------RcppExports.cpp(3KB)
--------.gitignore(15B)
--------forceatlas2.cpp(14KB)
----inst()
--------shinyGUI()
----R()
--------shiny_helpers.R(515B)
--------forceatlas2.R(7KB)
--------scgraphs-package.R(107B)
--------io.R(3KB)
--------scaffold.R(23KB)
--------RcppExports.R(2KB)
--------unsupervised.R(9KB)
----.Rbuildignore(28B)
----LICENSE(34KB)
----README.md(6KB)
----man()
--------cosine_similarity_from_matrix.Rd(608B)
--------get_highest_scoring_edges.Rd(1KB)
--------write_scaffold_output.Rd(2KB)
--------filter_matrix.Rd(815B)
--------get_scaffold_map.Rd(2KB)
--------add_vertices_to_landmarks_graph.Rd(1KB)
--------vite.Rd(156B)
--------run_scaffold_analysis.Rd(2KB)
--------write_clusters_data.Rd(1KB)
--------write_graph.Rd(525B)
--------complete_forceatlas2.Rd(2KB)
--------get_unsupervised_graph_from_files.Rd(4KB)
--------cosine_similarity_matrix.Rd(575B)
--------layout_forceatlas2.Rd(2KB)
--------vite_GUI.Rd(549B)
--------get_distances_from_landmarks.Rd(1KB)
--------load_landmarks_from_dir.Rd(1KB)
--------get_unsupervised_graph.Rd(931B)
--------filter_matrix_by_rank.Rd(929B)
--------write_landmarks_data.Rd(548B)
--------distance_from_attractor_hard_filter.Rd(1KB)
--------load_landmarks.Rd(1KB)
--------add_inter_clusters_connections.Rd(997B)
--------build_graph.Rd(918B)
--------downsample_by.Rd(876B)
--------build_umap_graph.Rd(20KB)
----.gitignore(22B)
----scgraphs.Rproj(396B)