文件名称:sc-compReg:R封装用于单细胞比较法规分析
文件大小:136.65MB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-03-31 01:12:31
C++
scCompReg scCompReg(šingle-有丝Çomparativeřegulatory分析)是提供耦合scRNA-SEQ和scATAC-SEQ的聚类和关节嵌入在一个样品上的R包,和两个条件之间进行比较的基因调控分析。 请通过?function (例如?sc_compreg )检查手册页,以获取有关输入和输出类型的详细说明。 系统要求 R(> = 3.6.0) Bedtools(Linux) 荷马(Linux) 变更记录 v1.0.0 scCompReg第一版。 安装 使用以下命令从源代码安装scCompReg R软件包: require( devtools ) devtools :: install_github( " SUwonglab/sc-compReg " ) 例子 有关使用scCompReg方法的完整示例,请参考example.R 。 必要的数据已上载到