clusterExperiment:R套技术,用于比较单细胞测序数据的聚类

时间:2024-06-08 16:02:10
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更新时间:2024-06-08 16:02:10

R

R包:clusterExperiment 用于运行和比较单细胞测序数据的许多不同聚类的功能。 新闻与更新 2.3.0版在Bioconductor(开发版)上进行了许多新更改。 检出主要更改的。 有关完整的详细信息,请参阅文件。 先前版本的变更摘要: 2.0.0版 刊物 该软件包随附的论文可在以下位置找到: Risso D,Purvis L,Fletcher R,Das D,Ngai J,Dudoit S,Purdom E(2018年)“ clusterExperiment和RSEC:用于单细胞和其他大型基因表达数据集聚类的Bioconductor软件包和框架” PLoS Comput Biol。 2018 Sep 4; 14(9):e1006378 有一个github存储库(本文的提供了用于重现该手稿中的分析的代码。 演示了如何使用RSEC进行聚类,并将其作为带有slingsho


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