文件名称：DoubletFinder:R软件包，用于检测单细胞RNA测序数据中的双峰
文件大小：1.41MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-21 14:12:04
R
DoubletFinder（由Chris McGinnis编写的代码） DoubletFinder是一种R软件包，可预测单细胞RNA测序数据中的双峰。 DoubletFinder实现为与Seurat> = 2.0（ ）交互 DoubletFinder由Cell Systems在2019年4月发布： ://www.cell.com/cell-systems/fulltext/S2405-4712(19)30073-0 更新 （03/31/2020）内部化功能通常在“模式”包中使用，以实现与R v3.6及更高版本的兼容性。 （06/21/2019）向paramSweep_v3添加了并行化（感谢NathanSkeen！）-注意：进度不再更新，但是过程要快得多！ 修复了较小数据集的错误。 更新了自述文件。 （04/12/2019）为'paramSweep_v3'和'doubletFin
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DoubletFinder-master
----.gitignore(40B)
----NAMESPACE(31B)
----DoubletFinder.Rproj(356B)
----R()
--------parallel_paramSweep_v3.R(5KB)
--------paramSweep_v3.R(2KB)
--------kurtosis.R(174B)
--------paramSweep.R(4KB)
--------bimodality_coefficient.R(211B)
--------doubletFinder_v3.R(6KB)
--------find.pK.R(3KB)
--------modelHomotypic.R(134B)
--------skewness.R(153B)
--------doubletFinder.R(4KB)
--------summarizeSweep.R(2KB)
----.Rbuildignore(28B)
----DF.screenshots()
--------Results_Hashing.png(229KB)
--------BCmvn.png(110KB)
--------Results_Simulation.png(98KB)
--------Results_Demux.png(308KB)
--------ParamSweep_HeatMap.png(37KB)
--------DFkidney_low.vs.high.png(91KB)
--------Simulation_Schematic.png(181KB)
--------ParamSweep_Schematic.png(72KB)
--------HomotypicAdjustment.png(159KB)
--------DoubletFinderOverview.png(159KB)
----man()
--------skewness.Rd(733B)
--------find.pK.Rd(1KB)
--------doubletFinder.Rd(3KB)
--------parallel_paramSweep_v3.Rd(2KB)
--------summarizeSweep.Rd(2KB)
--------kurtosis.Rd(711B)
--------modelHomotypic.Rd(1KB)
--------bimodality_coefficient.Rd(989B)
--------paramSweep.Rd(1KB)
--------doubletFinder_v3.Rd(3KB)
--------paramSweep_v3.Rd(1KB)
--------doubletFinder_ParamSweep.Rd(1KB)
----README.md(13KB)
----DESCRIPTION(1KB)