DevKidCC:用于在单细胞RNA测序数据中对肾细胞进行分类的包装

时间:2024-05-03 04:35:17
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文件名称:DevKidCC:用于在单细胞RNA测序数据中对肾细胞进行分类的包装

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更新时间:2024-05-03 04:35:17

R

DevKidCC DevKidCC(开发私奔儿童有丝lassifier滋肾C)是一种工具,将单细胞肾数据进行分类,这两种人组织和人干细胞衍生的类器官。 尽管我们确实建议过滤掉质量较差的像元以最准确地表示像元比例,但不需要进行预处理。 bioRxiv论文: 安装 您可以使用devtools从此存储库安装DevKidCC : # prerequite scPred package devtools :: install_github( " powellgenomicslab/scPred " ) # DevKidCC itself devtools :: install_github( " KidneyRegeneration/DevKidCC " , ref = " main " ) 标准工作流程 查看完整的插图,其中包括有关使用可视化功能的详细信息 运行DevKidCC DevK


【文件预览】:
DevKidCC-main
----man()
--------SankeyPlot.Rd(1KB)
--------ComponentPlot.Rd(424B)
--------IdentBoxPlot.Rd(442B)
--------organoid.Rd(633B)
--------DotPlotCompare.Rd(2KB)
--------DevKidCC_Models.Rd(1013B)
--------pipe.Rd(261B)
--------GeneSummary.Rd(377B)
--------DevKidCC.Rd(467B)
--------DevKidCC-package.Rd(508B)
----data()
--------model2_stroma.rda(17.04MB)
--------model3_rc.rda(14.19MB)
--------organoid.rda(24.37MB)
--------model1_all.rda(40.09MB)
--------reference.rda(15.44MB)
--------model2_nephron.rda(27.01MB)
--------model3_dn.rda(10.69MB)
--------model3_pn.rda(8.66MB)
--------model2_urep.rda(8.49MB)
----NAMESPACE(2KB)
----.Rhistory(29KB)
----DevKidCC.Rproj(386B)
----NEWS.md(54B)
----tests()
--------testthat()
--------testthat.R(60B)
--------githelp(135B)
----Model_Graphic.png(1.32MB)
----LICENSE(1KB)
----vignettes()
--------DevKidCC.Rmd(7KB)
--------.gitignore(10B)
--------DevKidCC.html(910KB)
----.Rbuildignore(47B)
----.gitignore(75B)
----R()
--------organoid.R(395B)
--------gene_summary.R(5KB)
--------DevKidCC_Models.R(435B)
--------DevKidCC.R(6KB)
--------visualisation.R(22KB)
--------DevKidCC-package.R(1KB)
--------globals.R(446B)
--------utils-pipe.R(207B)
----DESCRIPTION(783B)
----README.md(2KB)

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