文件名称：RGT:重复基因分型工具-开源
文件大小：37.75MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-20 23:29:59
开源软件
用于来自靶向测序读数的简单序列重复结构的免比对基因分型软件 简单序列重复结构通常使用靶向测序进行基因分型，其中产生来自同一基因座的数千个序列读数。 然后将这些读数与代表样品中可能存在的所有可能重复结构的数千个参考序列进行比对。 这种方法容易出错，因为它很可能将之前未鉴定的基因结构误认为是未鉴定的SNP，当然整个过程非常耗时。 RGT 从原始 fastq 读数中识别 SSR 结构，识别并导出 gremlin 等位基因，以及单位计数的二维图（作为电泳图）。 它还导出重复单元计数的 3D 绘图，这些图在存在多个扩展重复的位点中相互比较
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RGT