graphtyper:使用全基因组图进行人口规模基因分型

时间:2024-05-20 18:21:15
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文件名称:graphtyper:使用全基因组图进行人口规模基因分型

文件大小:658KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-05-20 18:21:15

bioinformatics graph genetics variants genotype

图类型器 graphtyper是一个高度可扩展的基于图的变体调用程序。 它代表使用无环图结构的参考基因组和基因组区域的已知变体(“泛基因组参考”),高通量序列读数经过重新比对,以发现和基因分型SNP,小的插入缺失和结构变体。 维护者: ( ) 安装 静态二进制发行 安装GraphTyper的最简单方法是转到“发布”并在此处下载最新的二进制文件: : 该二进制文件是静态链接的,因此不需要任何运行时库。 如果愿意,还可以通过bioconda安装graphtyper: ://bioconda.github.io/recipes/graphtyper/README.html 从源头建造 您可能还想从源代码构建graphtyper,例如,如果要更改代码。 在这种情况下,您首先需要满足以下条件: 具有完全AVX512支持的C ++编译器(GCC 7+) 升压> = 1.57.0 z


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