文件名称：TARGT pipeline:用于 HLA/MHC 基因分型的序列读数的靶向分析-开源
文件大小：3.69MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-20 21:08:00
开源软件
用于基因分型测序读数的靶向分析的“TARGT”管道可用于从具有中到低序列覆盖率的古代和现代鸟枪序列数据中对 MHC/HLA 基因（或其他基因组区域）进行基因分型。 管道由调用管道不同步骤的主 bash 脚本组成，可以直接调用或提交到集群队列系统，以及执行不同步骤所需的附加子脚本和文件。 该管道还需要安装映射工具 Bowtie2 和 samtools 的版本。
【文件预览】：
TARGT.bs
AllelelLibrary.KnownAlleles.zip
reference.zip
readme.txt