tGCN:靶向基因共表达网络分析的灵活协议

时间:2024-06-25 02:58:20
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文件名称:tGCN:靶向基因共表达网络分析的灵活协议

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更新时间:2024-06-25 02:58:20

R

tGCN 靶向基因共表达网络分析的灵活协议 “靶向基因共表达网络分析的灵活协议”(Coman 等人,2014 年)提出了一个用户友好的工作流程,使用大规模基因表达数据进行靶向基因共表达网络分析,并解释了设计和数据的关键步骤分析功能相关模块的预测。 强调: - infers statistically significant gene co-expression networks - uses quantitative data generated by RNA-seq, microarrays, RT-qPCR, proteomics etc. for any organism - runs on various platforms (Linux, Mac, Windows) - uses exclusively open source software (R, Cytoscape


【文件预览】:
tGCN-master
----Demo()
--------guide_expression.txt(3KB)
--------query_group2_expression.txt(3KB)
--------query_expression.txt(4KB)
--------query_groups_names.txt(66B)
--------query_group1_expression.txt(4KB)
----CytoscapeInput.R(2KB)
----README.md(1KB)
----Citation(176B)
----tGCN.R(8KB)

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