文件名称：RUN-WGCNA:包装程序R脚本，用于执行加权基因共表达网络分析（WGCNA）
文件大小：3.72MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-08 10:44:09
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布局 标题 日期 邮政 包装程序，用于运行共表达网络分析（WGCNA） 2015-07-23 运行WGCNA 包装器功能可进行快速的初步加权基因共表达网络分析 背景 加权相关网络分析，也称为加权基因共表达网络分析（WGCNA），是一种广泛使用的数据挖掘方法，尤其用于基于变量之间的成对相关性研究生物网络。 尽管它可以应用于大多数高维数据集，但已在基因组学应用中得到最广泛的使用。 WGCNA方法在分析基因表达数据方面具有非常强大的功能，以获得典型的差异表达实验无法获得的结果和见解。 可以使用的WGCNA R包来实现WGCNA方法和算法并且有可供使用。 尽管这些教程非常出色，但是学习曲线却很陡峭，并且要求分析人员相当精通R编程。 经常被问到如何执行WGCNA时，我想我将分享一些有助于WGCNA入门的主要功能的包装脚本。 我必须强调，使用这些功能不会使分析人员对这种方法的工作原理有更多的了
【文件预览】：
RUN-WGCNA-master
----readme.Rmd(9KB)
----readme.md(8KB)
----run-wgcna.png(27KB)
----exprsExtimates.csv.zip(3.39MB)
----WGCNA_functions.R(14KB)
----RUN-WGCNA.Rproj(205B)
----coExpressionAnalysis.R(2KB)
----plots()
--------powerPlots.png(79KB)
--------modClusterPlot.png(30KB)
--------eigengenBoxplot.png(47KB)
--------modClusterPlot.pdf(112KB)
--------eigengenBoxplots.png(47KB)
--------powerPlots.pdf(5KB)
--------eigengenBoxplots.pdf(3KB)
----.gitignore(37B)
----readme.html(22KB)