泛基因组图构建器-Linux开发

时间:2021-05-27 17:18:33
【文件属性】:
文件名称:泛基因组图构建器-Linux开发
文件大小:2.47MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-27 17:18:33
Linux System utilities 该pangenome图构建管道将序列的集合渲染到pangenome图中(在变异图模型中)。 它的目标是建立一个局部有向图和无环图,同时保留大范围的变化。 pggb pangenome图构建器此pangenome图构建管道将序列的集合渲染到pangenome图中(在变异图模型中)。 它的目标是建立一个局部有向图和无环图,同时保留大范围的变化。 维持局部线性对于全景基因组变异图的解释,可视化和重用很重要。 它使用三个阶段:edyeet :(对齐)-基于概率的mash-map和基于编辑距离的映射器是
【文件预览】:
pggb-master
----.gitignore(30B)
----Dockerfile(3KB)
----pggb(17KB)
----data()
--------images()
--------HLA()
--------LPA()
----LICENSE(1KB)
----.github()
--------workflows()
----README.md(17KB)

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