文件名称：svaba:通过局部组装进行结构变异和插入缺失检测
文件大小：1.29MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-25 23:10:43
c-plus-plus variants structural-variations indels assembled-contigs
SvABA-通过装配进行结构变异和插入缺失分析 [此项目以前是“雪人”] 许可证： 目录 查看所有ASCII对齐方式 查看重叠群比对的特定重叠群 使函数对重叠群进行排序和索引 归因 安装 我们建议使用GCC-4.8或更高版本进行编译。 我们已经在RHEL6，带有GCC-4.8、4.9和5.1的CentOS和带有Clang的MacOSX（Apple LLVM版本7.0.2（clang-700.1.81））上成功进行了编译。 git clone --recursive https://github.com/walaj/svaba cd svaba ./configure make make install ## QUICK START (eg run tumor / normal on Chr22, with 4 cores) bin/svaba -t tumor.bam -n nor