文件名称：pqpq_python:在python中重新编写pqpq，在肽或psm级别进行聚类
文件大小：5KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-05 17:09:12
Python
pqpq_python 用python重写PQPQ（最初由Jenny Forshed博士在MATLAB中开发）。 PQPQ是一种算法，可根据在样品中定量模式将在质谱图中鉴定的肽聚类。 由瑞典Karolinska研究所的朱亚峰（Yafeng Zhu）撰写。 电子邮件： 参考： 通过蛋白质定量和肽质量控制（PQPQ）从shot弹枪蛋白质组学数据输出增强的信息。 Forshed等。 摩尔细胞蛋白质组学。 2011年10月 在shot弹枪蛋白质组学中的剪接变异分析中的应用： SpliceVista，一种用于在shot弹枪蛋白质组学数据中进行剪接变体识别和可视化的工具。 朱等。 摩尔细胞蛋白质组学。 2014年6月 输入格式： 制表符分隔的PSM或“肽”表。 第一行是标题。 肽序列和蛋白质登录号分别位于第一列和第二列，其余列可以是强度值或肽比率。 例1 python pq
【文件预览】：
pqpq_python-master
----README.md(3KB)
----pqpq2.py(5KB)
----grouppsm.py(3KB)