文件名称：GenoAnnoFlow:基因组注释管道和可视化
文件大小：69KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-03 23:50:15
Python
GenoAnnoFlow 基因组注释管道和可视化
【文件预览】：
GenoAnnoFlow-master
----.gitignore(16B)
----functional_annotation()
--------add_functional.sh(766B)
--------03_make_IPRtab.sh(80B)
--------02_make_big_qsub.sh(253B)
--------01_make_split.sh(213B)
--------README.md(221B)
--------run_swissprot_blast.sh(341B)
--------run_swissprot_blast_array.sh(713B)
----scripts()
--------README.md(210B)
--------splitFasta.py(10KB)
--------zff2augustus_gbk.pl(2KB)
----README.md(60B)
----genome_annotation()
--------do_hmmer.sh(368B)
--------01a_train_SNAP.sh(557B)
--------02a_prepare_maker.sh(301B)
--------generateFeatureCounts.r(258B)
--------02c_merge_maker.sh(757B)
--------README.md(409B)
--------01b_train_AUGUSTUS.sh(564B)
--------generateAEDplots.r(411B)
--------get_gff_fasta.sh(306B)
--------03_map_ids.sh(318B)
--------02b_run_maker.sh(391B)
--------01c_train_GeneMarkHMM.sh(275B)
--------rename_contigs.sh(56B)
----docs()
--------Gene Annotation Pipeline.pdf(138KB)
--------README.md(53B)