文件名称：bacannot:用于原核基因组注释的通用管道
文件大小：1.41MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-26 18:28:04
pipeline annotation nextflow reproducible-research virulence-factor
细菌注释（bacannot）管道 Bacannot是易于使用的基于docker的nextflow管道，该管道采用最新软件进行原核基因组注释。 它是围绕几种工具的包装，使您可以更好地了解原核基因组。 它用： 用于通用注释 rRNA预测的 用于在多基因座序列类型（ST）中进行分类的 for KO批注 用于绘制KO注释 用于甲基化注释 用于基因组浏览器生产 的注释合并 用于绘制基因组岛 用于抗菌基因注释的 ， ， 和 数据库， 和用于序列和基因预测 用于基因组岛预测 用于计算机质粒检测的和 数据库，用于注释整合和共轭元素 和用于注释毒力基因 进一步阅读和补充分析 为了使管道更健壮和更全面，正在开发一个名为的工具包。 它是使用此管道的结果进行比较基因组分析的工具包。 它仍然是一个新事物，但是还不完整，但是仍在不断发展中。 该工具包可能会根据社区需求而增长。 此外，该管道还有两个互补