bacannot:用于原核基因组注释的通用管道

时间:2021-03-07 00:41:24
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文件名称:bacannot:用于原核基因组注释的通用管道
文件大小:1.41MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-03-07 00:41:24
pipeline annotation nextflow reproducible-research virulence-factor 细菌注释(bacannot)管道 Bacannot是易于使用的基于docker的nextflow管道,该管道采用最新软件进行原核基因组注释。 它是围绕几种工具的包装,使您可以更好地了解原核基因组。 它用: 用于通用注释 rRNA预测的 用于在多基因座序列类型(ST)中进行分类的 for KO批注 用于绘制KO注释 用于甲基化注释 用于基因组浏览器生产 的注释合并 用于绘制基因组岛 用于抗菌基因注释的 , , 和 数据库, 和用于序列和基因预测 用于基因组岛预测 用于计算机质粒检测的和 数据库,用于注释整合和共轭元素 和用于注释毒力基因 进一步阅读和补充分析 为了使管道更健壮和更全面,正在开发一个名为的工具包。 它是使用此管道的结果进行比较基因组分析的工具包。 它仍然是一个新事物,但是还不完整,但是仍在不断发展中。 该工具包可能会根据社区需求而增长。 此外,该管道还有两个互补

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