文件名称：PHP:原核病毒宿主预测器（PHP）是基于高斯模型（GM）的原核病毒宿主预测的计算工具。 PHP将原核病毒的完整或部分基因组序列作为输入。 对于每个病毒序列，PHP自动计算60,105个原核基因组的宿主概率，并以概率最大的原核基因组作为预测宿主。 PHP将输出得分最高的原核基因组名称，并输出所有原核基因组的宿主分数
文件大小：77.11MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-04 00:06:12
Python
原核病毒宿主预测因子（PHP） 原核病毒宿主预测器（PHP）是一种基于高斯模型（GM）的原核病毒宿主预测的计算工具。 PHP将原核病毒的完整或部分基因组序列作为输入。 对于每个病毒序列，PHP自动计算60,105个原核基因组的宿主概率，并以概率最大的原核基因组作为预测宿主。 PHP将输出得分最高的原核基因组名称，并输出所有原核基因组的宿主分数。 Python包pandas ， numpy ， sklearn需要phageHostPredictor安装之前安装。 该程序需要在Linux操作系统上运行 依存关系： Python 3，numpy，pandas，scikit-learn pip install pandas pip install numpy pip install -U scikit-learn 用法： 步骤1：计算主机的K- mer频率 python3 countKmer.