sv-benchmark:基于PacBio CCS HG002数据的长期阅读的结构变异调用者的公开基准

时间:2021-05-24 04:51:38
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文件名称:sv-benchmark:基于PacBio CCS HG002数据的长期阅读的结构变异调用者的公开基准
文件大小:59KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 04:51:38
结构变体调用基准 该基准基于Ashkenazim儿子HG002 / NA24385的PacBio CCS 15kb公开数据集。 我们提供每个步骤,说明如何使用公开可用的工具重现最终指标。 如果发现错误或想要添加工具,请告诉我们。 比较 28倍覆盖率: 跑步 F1 ^% 精确 % 记起 % FP FN FP + FN 96.29 94.61 98.02 538 191 729 94.12 93.76 94.48 606 532 1138 93.56 93.30 93.83 650 595 1245 5、10和28倍的覆盖滴定度: 取得工具 有关如何安装conda和添加bioconda通道的信息,访问 。 conda create --name sv python=3.6 source activate sv conda install pbmm
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