【文件属性】:
文件名称:sv-benchmark:基于PacBio CCS HG002数据的长期阅读的结构变异调用者的公开基准
文件大小:59KB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-24 04:51:38
结构变体调用基准
该基准基于Ashkenazim儿子HG002 / NA24385的PacBio CCS 15kb公开数据集。 我们提供每个步骤,说明如何使用公开可用的工具重现最终指标。
如果发现错误或想要添加工具,请告诉我们。
比较
28倍覆盖率:
跑步
F1 ^%
精确 %
记起 %
FP
FN
FP + FN
96.29
94.61
98.02
538
191
729
94.12
93.76
94.48
606
532
1138
93.56
93.30
93.83
650
595
1245
5、10和28倍的覆盖滴定度:
取得工具
有关如何安装conda和添加bioconda通道的信息,访问 。
conda create --name sv python=3.6
source activate sv
conda install pbmm
【文件预览】:
sv-benchmark-master
----img()
--------ccs_metrics.png(64KB)
----README.md(12KB)