【文件属性】：
文件名称：sv_benchmark:结构变体调用者的综合基准
文件大小：53.52MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-23 23:43:57
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此处提供手稿： :
结构变异基准
该项目包含用于SV基准测试和结果可视化的脚本集合。 项目结构如下：
用于创建基准测试VCF的脚本
输入*：给定样本的参考数据
data。*：包含给定样本的测序数据和变体调用的目录
数据。 / .metadata：生成的文件bash变量，包含有关文件的元数据（例如，库片段大小，对齐器，变体调用程序，...）
alignbam.sh：用于运行对齐器的脚本（fastq到BAM）
common.sh：辅助工具脚本。 包含通用功能，例如加载/保存元数据和执行作业。
call _ *。sh：用于运行相关变体调用程序的Bash Shell脚本（fastq / BAM到VCF）
bamtofastq.sh：转换脚本，因此基于de novo程序集的变体调用程序可以在具有输入BAM文件的样本上运行
* 2vcf.py：帮助程序脚本，用于使用自定义格式将变量调用者的