文件名称:ideel:插入缺失不是理想的-快速检测细菌微生物基因组中中断的ORF
文件大小:4KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-05-30 13:11:14
R
意识形态 该回购建立在米克·沃森谁写了,并有关的快捷方式组装测试(长读)的可行性。 依存关系: 蛇纹 浪子 钻石 R(包括库readr和ggplot2) 您将需要像UniProt TREMBL这样的Diamond索引。 跑步 克隆仓库。 工作流的输出将被写入--directory 。 在其中创建一个名为“ genomes”的目录,并在其中以.fa文件扩展名放置程序集 编辑config.json文件,指定例如Diamond数据库的路径。 然后: # http://snakemake.readthedocs.io/en/stable/executable.html # http://snakemake.readthedocs.io/en/stable/snakefiles/configuration.html snakemake --configfile config.json --
【文件预览】:
ideel-master
----.gitignore(2KB)
----Snakefile(1KB)
----scripts()
--------hist.R(3KB)
----README.md(1KB)
----config.json(77B)