文件名称：cgpPindel:基于Pindel的癌症基因组计划插入删除检测管线
文件大小：10.6MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-04-20 10:46:26
Perl
cgpPindel cgpPindel包含了癌症基因组项目的工作流程 。 掌握 发展 该版本是Pindel v2.0的略微修改版本，具有CGP特定处理功能，可用于： 输入文件生成 从Pindel文本输出转换为： 肿瘤和正常BAM对齐文件 VCF VCF过滤器的应用。 内容： Docker，奇点和Dockstore 在quay.io上有包含此代码库的预构建图像。 ：包含在此存储库中 使用cgpPindel所需的最小构建 尚未链接到Dockstore（尚未） 更新最频繁 ：包含特定于WXS分析的工具。 ：包含用于WGS分析的其他工具。 这些主要是为与dockstore.org一起使用而设计的，但可以用作常规容器。 已知将docker映像导入奇异性映像后可以正常工作。 依赖项/安装 请先安装以下内容： 请参阅这些以了解任何子依赖项。 完成后，请运行： ./s
【文件预览】：
cgpPindel-dev
----LICENCE(34KB)
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----c++()
--------pindel.cpp(251KB)
--------filter_pindel_reads.cpp(30KB)
----prerelease.sh(3KB)
----Dockerfile(2KB)
----CHANGES.md(5KB)
----INSTALL(583B)
----perl()
--------bin()
--------MANIFEST(2KB)
--------docs.tar.gz(174KB)
--------t()
--------MANIFEST.SKIP(1024B)
--------Makefile.PL(2KB)
--------rules()
--------lib()
----.gitignore(337B)
----.circleci()
--------config.yml(3KB)
----.dockerignore(124B)
----README.md(5KB)
----setup.sh(2KB)
----build()
--------opt-build.sh(2KB)
--------opt-build-local.sh(2KB)