文件名称：novoBreak:稳健检测癌症基因组中的体细胞结构断点-开源
文件大小：1.73MB
文件格式：GZ
更新时间：2024-07-19 00:39:52
开源软件
novoBreak 是一种用于癌症基因组研究的工具，用于发现 SV（体细胞和种系）断点。 它可以报告准确的删除 (DEL)、重复 (DUP)、倒置 (INV) 和易位 (TRA) 断点（您应该考虑其中一些是移动元素插入或模板化插入）。 对于新的插入，我们可能只报告断点而不是插入的序列。 请暂时忘记新的插入内容。 我们稍后会处理这个问题。 它专为 Illumina 双端数据而设计。
【文件预览】：
novoBreak_distribution_v1.1.3rc
----group_bp_reads.pl(4KB)
----fetch_discordant.pl(3KB)
----filter_sv2.pl(980B)
----infer_bp.pl(4KB)
----README(4KB)
----filter_sv_icgc.pl(1KB)
----SSAKE(81KB)
----bwa(933KB)
----infer_bp_v4.pl(5KB)
----run_ssake.pl(2KB)
----samtools(3.15MB)
----filter_sv.bak.pl(1KB)
----filter_sv.pl(1KB)
----run_novoBreak.sh(2KB)
----infer_sv.pl(13KB)
----novoBreak(686KB)