文件名称：juniperus_paper:用于分析真菌群落的Illumina MiSeq配对末端数据的管道
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更新时间：2024-06-13 17:51:58
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与菌根植物杜鹃，皱皮栎相关的真菌群落及其对森林恢复的影响 背景和样本信息 我正在使用Metabarcoding处理具有ITS2 rDNA区域的ITS2 rDNA区域的末端配对数据，以鉴定土壤中以及分离的和混合的橡树（ Quercus rugosa ）和杜松（ Juniperus deppeana ）种群的幼苗根中存在的真菌群落。 为此，我使用了真菌特异性引物ITS4ngsUNI和gITS7ngs ，其设计为可作用于多种真菌（ Leho Tedersoo和Lindahl，2016年）。 目的是研究墨西哥中部沿干扰梯度的杜松和栎之间的地下相互作用。 由于橡树和杜松是具有不同菌根类型的植物，橡树被称为外生菌根植物，而ipe藜则被称为丛生-菌根植物，因此我希望一种植物的存在通过地下真菌相互作用对另一种植物产生影响，从而引起植物生长和健康以及对真菌群落的丰度和多样性（ Teste，2019; De