【文件属性】：
文件名称：Filtlong:高质量的过滤工具，可长时间读取
文件大小：2.88MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-25 07:17:17
C++
Filtlong是用于按质量过滤长读的工具。 它可能需要进行长时间的读取，并产生一个较小的更好的子集。 它采用两个读出长度（较长越好）和读身份（更高更好是）时选择其读取通过过滤器。
目录
要求
Linux或macOS
C ++编译器（应使用GCC 4.8或更高版本）
zlib（通常包含在Linux / macOS中）
安装
Filtlong内置于独立的可执行文件中：
git clone https://github.com/rrwick/Filtlong.git
cd Filtlong
make -j
bin/filtlong -h
如果您打算大量使用Filtlong，建议您将其复制到PATH中的目录中：
cp bin/filtlong /usr/local/bin
示例命令（快速）
没有外部参考
filtlong --min_length 1000 --keep_percent
【文件预览】：
Filtlong-main
----src()
--------kseq.h(9KB)
--------arguments.cpp(11KB)
--------read.cpp(10KB)
--------misc.cpp(1KB)
--------main.cpp(12KB)
--------kmers.cpp(7KB)
--------kmers.h(2KB)
--------misc.h(977B)
--------read.h(2KB)
--------args.h(82KB)
--------bloom_filter.h(22KB)
--------arguments.h(2KB)
----scripts()
--------histogram.py(12KB)
--------read_info_histograms.sh(2KB)
--------README.md(19KB)
----LICENSE(34KB)
----test()
--------test_sort.fasta(15KB)
--------test_sort.txt(367B)
--------test_split.txt(256B)
--------test_error_messages.py(9KB)
--------make_synthetic_reads.py(5KB)
--------test_trim.txt(184B)
--------test_bad_fastq.fastq(29KB)
--------test_trim.py(5KB)
--------test_reference_1.fastq.gz(923KB)
--------__init__.py(0B)
--------test_reference.fasta(99KB)
--------test_split.py(11KB)
--------test_reference_2.fastq.gz(924KB)
--------README.md(330B)
--------test_sort.py(18KB)
--------test_trim.fastq(10KB)
--------test_sort.fastq(29KB)
--------test_split.fastq(23KB)
----README.md(23KB)
----Makefile(1KB)
----misc()
--------example_commands_1_without_reference.png(113KB)
--------trim_example_1.png(14KB)
--------trim_example_2.png(14KB)
--------example_commands_5_quality_priority.png(72KB)
--------example_commands_2_with_reference.png(104KB)
--------filtlong_logo.png(98KB)
--------example_commands_0_unfiltered.png(252KB)
--------score_equation.png(49KB)
--------read_length_identity.py(3KB)
--------split_example_1.png(15KB)
--------trim_split_example_real_read.png(12KB)
--------split_example_2.png(17KB)
--------example_commands_4_length_priority.png(144KB)
--------example_commands_3_trim_split.png(104KB)
----.gitignore(157B)