NextDenovo:快速准确的从头汇编程序,可长时间读取

时间:2024-06-12 03:07:23
【文件属性】:

文件名称:NextDenovo:快速准确的从头汇编程序,可长时间读取

文件大小:353KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-06-12 03:07:23

assembly assembler oxford-nanopore genome-assembly long-reads

下一个 NextDenovo是基于字符串图的从头汇编程序,用于长读取(CLR,HiFi和ONT)。 它使用类似于canu的“先校正后再组装”策略(PacBio Hifi读取无需校正步骤),但所需的计算资源和存储量却大大减少。 组装后,每碱基的准确性约为98-99.8%,为进一步提高单一碱基的准确性,请使用 。 我们使用来自和牛津纳米Kong长读本,以及PacBio连续长读本(CLR),将NextDenovo与其他汇编程序进行比较。 与其他工具相比,NextDenovo使用更少的重叠群生成更多的连续组件。 NextDenovo在装配一致性和单基座精度方面也显示出很高的装配精度。 安装 下载单击或使用以下命令: wget https://github.com/Nextomics/NextDenovo/releases/download/v2.4.0/NextDenovo.tgz 注意:如果


【文件预览】:
NextDenovo-master
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----doc()
--------OPTION.rst(6KB)
--------UTILITY.rst(7KB)
--------TEST3.rst(12KB)
--------TEST4.rst(10KB)
--------run.cfg(845B)
--------TEST2.rst(8KB)
--------TEST4.pdf(85KB)
--------TEST2.pdf(409KB)
--------TEST1.rst(2KB)
--------FAQ.rst(5KB)
--------TEST3.pdf(141KB)
--------index.rst(483B)
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----.gitignore(1KB)
----README.md(3KB)

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