NextPolish:快速准确地抛光长时间读取产生的基因组

时间:2024-04-04 17:18:36
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文件名称:NextPolish:快速准确地抛光长时间读取产生的基因组

文件大小:168KB

文件格式:ZIP

更新时间:2024-04-04 17:18:36

genome assembly polish

下一个波兰语 NextPolish用于修复由嘈杂的长时间读取产生的基因组中的基本错误(SNV / Indel),它可用于仅短读数据或仅长读数据或两者结合使用。 它包含两个核心模块,并采用逐步方式来校正参考基因组中的错误碱基。 要更正/组装原始的第三代测序(TGS)长读,并产生约10-15%的测序错误,请使用 。 安装 下载单击或使用以下命令: wget https://github.com/Nextomics/NextPolish/releases/download/v1.3.1/NextPolish.tgz 注意:如果出现诸如version 'GLIBC_2.14' not found或liblzma.so.0: cannot open shared object file ,请下载。 要求 (支持python 2和3): (仅在非本地系统下运行才需要) 安装tar -vxzf


【文件预览】:
NextPolish-master
----.github()
--------ISSUE_TEMPLATE()
----doc()
--------run.cfg(441B)
--------QSTART.rst(6KB)
--------FAQ.rst(4KB)
--------TEST2.rst(10KB)
--------TEST1.pdf(93KB)
--------TEST3.rst(6KB)
--------index.rst(357B)
--------TEST3.pdf(84KB)
--------TEST1.rst(10KB)
--------TUTORIAL.rst(6KB)
--------OPTION.rst(5KB)
----README.md(2KB)
----.gitignore(430B)

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