文件名称：bcbio.variation:用于分析基因组变异数据的工具包，基于带有Clojure的GATK
文件大小：638KB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-05-18 06:41:25
Clojure
生物变异 用于分析基因组变异数据的带有Clojure的 。 它支持计分，也是变体文件比较的通用框架。 通过自动化比较两组变体所涉及的过程，它可以验证变体并探索调用方法之间的算法差异。 对于用户而言，它与框架集成在一起，可以自动执行变量调用和验证。 对于开发人员，bcbio.variation提供了命令行工具和API，用于清理和规范化变体数据，从而避免了与不同变体表示形式相关的比较工件。 取得 下载 最新版本是0.2.6（2015年7月17日）： 。 从命令行运行： $ java -jar bcbio.variation-VERSION-standalone.jar [arguments] 该jar包含一个完整的GATK命令行以及其他walker，以及自定义命令行程序。 下面的用法部分包含使用该库进行变体比较，规范化和集合调用的示例。 请注意，bcbio.variation需要Java