基因组数据分析:用于分析基因组或转录组数据的管道

时间:2024-03-10 06:44:45
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文件名称:基因组数据分析:用于分析基因组或转录组数据的管道

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Shell

基因组数据分析 分析基因组或转录组数据的管道


【文件预览】:
genomic-data-analysis-master
----.gitignore(39B)
----lcwgs_data_analysis.md(17KB)
----scripts()
--------get_bam_list_per_pop.sh(2KB)
--------local_pca_2.R(1KB)
--------run_local_pca.sh(3KB)
--------run_pcangsd.sh(2KB)
--------get_heterozygosity.sh(2KB)
--------get_maf_per_pop.sh(2KB)
--------run_ngsLD.sh(993B)
--------get_beagle.sh(961B)
--------get_dxy_ngs_tools.R(3KB)
--------local_pca_1.sh(848B)
--------subset_beagle_by_lg.sh(1008B)
--------angsd_global_snp_calling.sh(2KB)
--------atlas_get_theta.sh(492B)
--------get_theta_per_pop.sh(3KB)
--------mtgenome_functions.R(2KB)
--------run_eems_fst.sh(220B)
--------individual_pca_functions.R(13KB)
--------run_ngsadmix.sh(807B)
--------get_fst.sh(3KB)
--------subset_bam.sh(976B)
----README.md(237B)
----genomic-data-analysis.Rproj(205B)

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