文件名称：microbiome:用于分析16S和元基因组数据的标准化分析管道
文件大小：2.64MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 05:49:59
bioinformatics pipeline docker-image microbiome R
微生物组项目管道 此存储库包含用于16S和元基因组数据的标准化分析管道。 它可作为分析约500个样品所需条件的试验场。 对于建议，未解决的问题和错误，请使用。 不同的管道通过分支机构进行管理。 master分支指向默认管道。 该项目本身由管理 有关分析模拟社区的示例，请参见 。 安装 如果要执行序列移除，则需要安装和人工参考。 这些工具捆绑在mbtools R软件包中，该软件包还取决于您需要运行分析的所有其他软件包。 您将需要先然后再运行 install.packages( ' devtools ' ) devtools :: install_github( ' cdiener/microbiome/mbtools ' ) 在R中 另外，您可以使用Docker镜像，该镜像通过查看此仓库自动构建并保持最新。 为此，您将需要使用Docker或可以运行docker的云实例（例如AWS或G