文件名称：vg：用于处理基因组变异图的工具
文件大小：24.27MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-03-17 21:14:41
genomics graph dna variation-graph genome-graph
vg 变异图数据结构，互换格式，对齐方式，基因分型和变异调用方法 变异图提供了许多基因组序列的简洁编码。 变异图（特别是在vg中实现）由以下部分组成： 节点，由序列和ID标记 边缘，通过两个端点的任意一端连接两个节点 路径，描述通过边缘连接的节点时的基因组，序列比对和注释（例如基因模型和转录本） 该模型类似于已在装配和多序列比对中使用的序列图。 路径提供了相对于图中编码的基因组的坐标系，即使更改了图的结构，也可以生成稳定的映射。 变异图模型使这种嵌入变得明确而必不可少。 vg中的工具在图形转换期间将路径保持不变。 他们使用路径将图形相对数据投影到参考相对坐标空间中。 路径为从相同输入序列以不同方式构建的图形提供稳定的坐标。 支持 我们在生物之星上设有一个支持论坛： ：//www.biostars.org/t/vg/ 安装 下载版本 获得vg的最简单方法是下载我们Linux发行版本