文件名称：leprosy_amg_network:单细胞和空间转录组学定义了人类麻风肉芽肿中抗菌React网络的细胞结构。
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更新时间：2024-05-14 11:35:53
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单细胞和空间转录组学定义了人类麻风肉芽肿中抗菌React网络的细胞结构。 概述 肉芽肿是复杂的细胞结构，主要由巨噬细胞和淋巴细胞组成，其功能是遏制和杀死入侵的病原体。 在这里，我们通过将单细胞和空间测序应用于麻风活检标本，研究了与人类麻风肉芽肿中的抗菌React相关的单细胞表型。 我们专注于逆转React（RR），这是一个动态过程，其中一些散布性麻风病（L-lep）患者向自限性结核性麻风病（T-lep）过渡，并产生有效的抗菌React。 我们确定了一组编码抗微生物React蛋白的基因，这些基因在RR与L-lep病变中差异表达，并受IFN-g和IL-1b调控。 通过整合关键细胞类型的空间坐标和RR和T-lep病变中的抗菌素基因表达，我们绘制了一张图，揭示了肉芽肿的组织结构，描绘了组成层和功能层，巨噬细胞，T细胞，角质形成细胞和成纤维细胞通过这些结构层和功能层参与其中。抗菌React。 脚本和
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leprosy_amg_network-main
----Rscripts()
--------scRNA-seq_Myeloid.R(3KB)
--------scRNA-seq_All_celltypes.R(3KB)
--------spatial-seq_RR6.R(4KB)
--------scRNA-seq_Tcells.R(3KB)
----README.md(2KB)
----Vignettes()
--------scRNA-seq_Myeloid.html(1.86MB)
--------scRNA-seq_All_celltypes.html(1.99MB)
--------spatial-seq_RR6.html(5.15MB)
--------scRNA-seq_Tcells.html(2.73MB)
--------example1.png(3.06MB)