MAESTRO:单细胞转录组和规则组分析管道

时间:2021-05-13 13:29:40
【文件属性】:
文件名称:MAESTRO:单细胞转录组和规则组分析管道
文件大小:100.23MB
文件格式:ZIP
更新时间:2021-05-13 13:29:40
transcription-factors epigenetics scrna-seq snakemake-workflows scatac-seq 马斯特罗 MAESTRO(S的基于Odel等M A nalys(E S)英格尔-T细胞的ranscriptome和R egulö我)是一个综合的单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析西装使用内置 。 MAESTRO结合了数十种工具和软件包,以创建一个集成的管道,从而可以从原始测序数据(fastq文件)一直进行比对,质量控制,细胞过滤,归一化,无监督聚类,差异表达,从而对scRNA-seq和scATAC-seq进行分析以及峰调用,细胞类型注释和转录调控分析。 目前,MAESTRO支持用于scRNA-seq协议的 , , ; 和用于scATAC-seq协议。 变更记录 v1.0.0 释放MAESTRO。 v1.0.1 提供docker映像以方便安装。 请注意,泊坞窗不包括cellranger / cellranger ATAC以及相应的基因组索引。 请按照安装说明安装cell

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