文件名称：MAESTRO:单细胞转录组和规则组分析管道
文件大小：100.23MB
文件格式：ZIP
更新时间：2024-06-02 07:16:20
transcription-factors epigenetics scrna-seq snakemake-workflows scatac-seq
马斯特罗 MAESTRO（S的基于Odel等M A nalys（E S）英格尔-T细胞的ranscriptome和R egulö我）是一个综合的单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析西装使用内置 。 MAESTRO结合了数十种工具和软件包，以创建一个集成的管道，从而可以从原始测序数据（fastq文件）一直进行比对，质量控制，细胞过滤，归一化，无监督聚类，差异表达，从而对scRNA-seq和scATAC-seq进行分析以及峰调用，细胞类型注释和转录调控分析。 目前，MAESTRO支持用于scRNA-seq协议的 ， ， ； 和用于scATAC-seq协议。 变更记录 v1.0.0 释放MAESTRO。 v1.0.1 提供docker映像以方便安装。 请注意，泊坞窗不包括cellranger / cellranger ATAC以及相应的基因组索引。 请按照安装说明安装cell